이번 달 펍 알림에서 Psomagen 연구소는 고객이 남아프리카 캐러칼의 유두종 바이러스와 중추 신경세포종의 종양 발생에 기여하는 요인을 조사하는 데 도움을 주었습니다. 

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남아프리카공화국 카라칼(카라칼 카라칼)에서 확인된 두 가지 유두종 바이러스 계통

Kraberger, S. et al.

유두종 바이러스(PV)는 가정 고양이와 야생 고양이 모두를 감염시키지만, 대부분의 종은 가축 중범죄에서 확인되었습니다. 이 연구 이전에는 PV의 존재에 대해 5종의 야생 고양이만 연구되었습니다. 이 연구는 메타게놈 분석을 사용하여 죽은 캐러칼 5마리의 배설물 샘플에서 PV를 식별했습니다. 바이러스 DNA 라이브러리는 일루미나 노바섹 X 플러스의 포마젠에서 시퀀싱되었습니다. 

이러한 결과는 캐러칼에 존재하는 두 속에서 6가지 새로운 PV 유형을 확인했습니다. 이러한 결과는 야생 고양이에 이전에 확인되지 않은 PV 종이 많이 있을 수 있음을 나타냅니다. 

중추 신경세포종은 FGFR3 저메틸화 및 과발현과 함께 방사상 신경교세포 시그니처를 나타냅니다.

Lee, Y. 외

국내 연구진은 전체 엑소좀, 벌크 RNA, 단일핵, 메틸화 염기서열 분석 등 다양한 오믹스 기술을 사용하여 중추신경세포종(CN) 성장의 기초가 되는 사건을 탐구했습니다. Psomagen은 10배 유전체학 기술을 사용하여 RNA 시퀀싱을 제공했습니다. 

게놈 전반에 걸친 프로파일링에서는 CN과 관련된 반복적인 돌연변이가 확인되지 않았습니다. 마찬가지로 CNV 호출은 어떤 염색체에서도 유의미한 이득 또는 손실을 나타내지 않았습니다. 이는 특정 게놈 돌연변이가 CN 성장에 관여하지 않을 수 있음을 나타냅니다. CN의 종양 돌연변이 부담도 다른 악성 뇌종양보다 현저히 낮았습니다. 이는 악성 변종이 존재하지만 대부분의 CN이 양성이라는 사실과 일치합니다. 

의 세 가지 유전자에 대한 변경 사항 PI3K-AKT 경로가 CN 발생의 잠재적 원인으로 확인되었습니다. CN은 또한 신경 발달 경로의 하향 조절과 축삭 유도 및 신경 세포 이동과 관련된 유전자의 상향 조절을 보여주었습니다. 이 연구에서 가장 관련성이 높은 발견은 CN의 FGFR3 유전자에 있는 세 개의 CpG 부위의 저메틸화였습니다. 이는 종양 발생의 주요 요인 중 하나로 FGFR3를 지적합니다.